ปกติน้ำผึ้งที่ดี ที่มีความเข้มข้นได้มาตรฐาน จะไม่เกิดการเสีย หรือเกิดรา เนื่องจากตัวน้ำผึ้งมีความเข้มข้นสูง และตัวมันเองมีคุณสมบัติยับยั้งการเจริญของเชื้อจุลินทรีย์ต่าง ๆ จากที่บอกว่า ถ้ายังไม่เปิดขวด จะปกติ เมื่อเปิดขวดออกใช้ส่วนที่เหลือจะขึ้นรา จึงคิดว่าน่าจะเกิดการปนเปื้อนขณะเปิดใช้ เช่น ใช้ช้อนไม่สะอาดในการตัก 

ส่วนการนำน้ำผึ้งไปแช่เย็น แล้วไม่มีเชื้อรา (ไม่แน่ใจว่าเป็นขวดเดิมหรือขวดใหม่) เนื่องจากราส่วนใหญ่จะเจริญเติบโตได้ดีที่อุณหภูมิ 25-30 องศาเซลเซียส ในตู้เย็นอุณหภูมิจะต่ำกว่านี้ เชื้อราจึงไม่เจริญ แต่โดยปกติน้ำผึ้งที่ได้มาตรฐาน สามารถเก็บไว้ที่อุณหภูมิห้องปกติได้โดยไม่เสีย เพียงแต่การตัก ควรใช้ช้อนที่สะอาด และเมื่อใช้เรียบร้อยแล้ว ควรปิดฝาใหเรียบร้อย

การนำน้ำผึ้งไปแช่เย็น จะทำให้น้ำผึ้งมีความหนืดสูง การนำมาใช้จะไม่สะดวก และน้ำผึ้งอาจตกผลึกได้